یکی از اصلی‌ترین انتقادات به این سامانه، ضعف‌های فنی جدی آن است. به نظر می‌رسد که سامانه صدف‌ها نه‌تنها از لحاظ فنی با مشکلات و ضعف‌های جدی مواجه است، بلکه از نظر عملکردی و محتوا نیز نه‌تنها در حد یک سامانه دولتی، بلکه در حد یک سامانه کسب‌وکار کوچک هم نبوده و فاقد اطلاعات کافی و چشمگیر است.

این موضوع باعث شده تا انتقادات زیادی درباره عملکرد و کارایی این سامانه به‌ویژه لزوم رونمایی شتابان از سامانه‌ای که عملا هیچ‌چیزی جز یک کار دانشجویی ضعیف نیست، مطرح شود. علاوه‌بر مشکلات فنی، سامانه صدف‌ها (متعلق به دولت) در اقدامی که تاکنون شاهد آن نبوده‌ایم، صرفا یک صفحه ساده فرود (Landing Page) بوده که در کمال ناباوری به یک سایت بخش خصوصی متصل شده است به این ترتیب عملا از سامانه‌ای رونمایی شده که چیزی به‌جز یک صفحه ساده نبوده و به منظور کاورکردن یک سامانه بخش خصوصی که حدود چهار سال پیش راه‌اندازی شده بوده است و مشخص نیست از چه مرجعی مجاز به افشای اطلاعات شرکت‌ها و ثبت آن‌هاست، مورد انتقاد قرار گرفته است.

روزنامه شرق