بر اساس اطلاعات منتشر شده توسط خبرگزاری مهر و به نقل از بانک مرکزی، در جهت افزایش کارایی و نفوذ چک‌های الکترونیکی در معاملات مالی در میان اعضای جامعه و همچنین بهبود شیوه‌های سامانه و ارتقای عملکرد آن، بخشنامه شماره ۰۵/۱۸۸۰۵۵ که در تاریخ ۲۵ مهرماه ۱۴۰۵ صادر شده، به شبکه بانکی ارسال گردید. این بخشنامه به تسهیل روند استفاده از چک‌های الکترونیکی و تامین الزامات امنیتی مربوط می‌شود.
در این بخشنامه به بازخوردهای ارائه شده از شبکه بانکی در خصوص مشکلات ناشی از صدور و نگهداری سخت‌افزاری توکن، دغدغه‌های لجستیک و توزیع گواهی الکترونیکی مهر برای اشخاص حقوقی و هزینه‌های مرتبط با آن توجه شده است. به همین منظور، استفاده از رمز یکبار مصرف (OTP) به سیم کارت متعلق به شخص حقوقی یا بهره‌بردار به عنوان یک گزینه ثانویه برای مهر زدن سازمان در چک‌های الکترونیکی پیش‌بینی شده است؛ به‌گونه‌ای که مشتری قادر به انتخاب بین ممهور کردن چک از طریق گواهی مهر سازمانی یا دریافت رمز یکبار مصرف خواهد بود.
کاربرد این روش مستلزم رعایت تمامی اصول و ملاحظات امنیتی است، از جمله نیاز به پیش‌بینی مکانیسم ارسال رمز یکبار مصرف به سیم‌کارت متقاضی و کنترل انطباق شماره تلفن همراه با کد ملی یا شناسه ملی مندرج در سامانه شاهکار که باید در تمامی درگاه‌های ارائه‌دهنده خدمات چک الکترونیکی به‌عمل آید.
علاوه بر این، به‌منظور تقویت امنیت و جلوگیری از خطرات و تبعات احتمالی، بانک‌ها موظفند هنگام انجام عملیات انتقال چک‌های کاغذی و الکترونیکی از مکانیزم ارسال رمز یکبار مصرف به سیم‌کارت شخص اقدام‌کننده بهره ببرند. این الزام همچنین در فرآیند تعیین وضعیت چک‌های الکترونیکی از طریق درگاه‌های غیرحضوری در تمامی پلتفرم‌های ارائه‌دهنده این خدمات اعمال می‌شود.